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Université Bordeaux 2

J'ai enseigné en tant qu'ATER à l'Université Bordeaux 2 (Victor Segalen) pendant l'année universitaire 2008-2009. Les cours sont détaillées ci-dessous.

Informatique

Informatique - Bureautique (TL1VT04U)

Il y a quelques années, le Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche a lancé un programme qui vise à délivrer aux lycéens et étudiants du supérieur un certificat prouvant que le déteneur a acquis des compétences dans l'utilisation d'outils des technologies de l'information et réseau. En particulier, le C2i Niveau 1 vise à l'efficacité de l'étudiant dans une variété de compétences nécessaires pour poursuivre les activités d'un programme d'enseignement supérieur :

Plus d'informations concernant ce certificat peuvent être obtenues sur le site du ministère.

Afin de préparer les étudiants au passage de ce certificat, des cours pratiques sont proposés dans tous les parcours de licence. Dans ce contexte, j'ai enseigné à 6 groupes d'environ 20 étudiants afin de les introduire à l'usage d'une suite bureautique courante. Les cours sont organisés comme suit :

Un autre enseignant était responsable d'une troisième séance sur Excel et d'une seconde séance consacrée à Power Point.

Ressources informatiques, banques de données et méthodes (TBS108)

La plupart des masters des parcours Biologie - Santé incluent ce module en première année. Son objectif est de fournir aux étudiants les connaissances nécessaires pour comprendre et utiliser des ressources bioinformatiques telles que des bases de données de biologie moléculaire ou des logiciels d'analyse de données biologiques (comparer et analyser des séquences biologiques, prédire la structure et la fonction d'une molécule, etc.)

Dans ce contexte, j'ai assuré un cours de 2h d'introduction aux ontologies biomédicales, afin que les étudiants aient un aperçu :

La version PDF du support de cours peut être téléchargée ci-dessous.

Téléchargement : pdf

Bioinformatique industrielle (TBS326)

Destinée aux étudiants de Master 2 Bioinformatique parcours professionnel, cette UE vise à donner aux étudiants une connaissance de la bioinformatique industrielle : le secteur, les produits et les métiers. Elle vise à les aider à construire leur projet d’insertion professionnelle.

L’enseignement théorique comprend d’une part des cours présentant les principes de la conduite de projet en milieu industriel et une série de conférences au cours desquelles des industriels viendront présenter leurs entreprises et métiers et répondre aux questions des étudiants concernant les perspectives de carrière offertes. L’enseignement dirigé se fait sous forme de projets réalisés individuellement ou en groupe. Les projets individuels comportent :

Les projets de groupe portent sur l’installation et l’évaluation d’un logiciel de bioinformatique. Ces projets débouchent également sur l’écriture d’un rapport et la présentation d’un exposé.

Je suis responsable de la partie projets de groupes de cette UE, qui consiste en une dizaine d'heures de présentiel pour une quinzaine d'étudiants. Les logiciels dont l'analyse est envisagée en 2008-2009 sont :

La version PDF du support qui sert d'introduction au projet d'analyse critique de logiciel peut être téléchargée ci-dessous.

Téléchargement : pdf

Mathématiques

Statistiques de base (TL6VT03U)

L'ensemble des parcours de licence en sciences de la vie inclut en troisième année une UE de statistiques de bases. Le but de cette UE est de donner les notions de bases des tests statistiques utilisés en biologie. Elle inclut des cours portant sur les thématiques suivantes :

Dans ce contexte, j'assure les 6 séances de TD associées à ces cours, pour 5 groupes d'une trentaine d'étudiants, pour un total de 60h de TD.

Les énoncés des TDs et contrôles que j'ai conçus peuvent être téléchargés ci-dessous. Les corrigés seront mis en ligne après que les TDs ou examens ont eu lieu.

Téléchargement :
TD Enoncé Corrigé
TD1 - Notions de probabilités pdf pdf
TD2 - Distributions observées pdf pdf
Contrôle Continu - Février 2009 - Sujet 1 pdf pdf
Contrôle Continu - Février 2009 - Sujet 2 pdf pdf
TD3 - Lois de probabilité pdf pdf
TD4 - Comparaison de fréquences pdf pdf
TD5 - Test de Chi2 pdf pdf

Statistiques : Compléments (TL6VTX3E)

Cette UE est proposée de manière optionnelle pour les étudiants en 3ème année de license en sciences de la vie. Le but de cette UE est de donner des compléments aux notions acquises dans l'UE "Statistiques de base". Elle inclut :

Dans ce contexte, j'assure les 3 séances de 4h de TP associés à ces cours, pour deux groupes d'une trentaine d'étudiants, pour un total de 24h.

Mathématiques appliquées à la biologie (TL4VTX4E)

En deuxième année de licence sciences de la vie, est proposée de manière optionnelle une UE de mathématiques à l'usage des biologistes. Le but de cette UE est de donner les notions de bases du calcul matriciel (avec application à la structure des réseaux métaboliques) et des notions simples sur les systèmes dynamiques. Les thématiques abordées sont :

Dans ce contexte, j'assure les 6 séances de 2h de TD associés à ces cours, pour un groupe d'une trentaine d'étudiants, pour un total de 12h.

Les énoncés des TDs que j'ai conçus peuvent être téléchargés ci-dessous. Les corrigés seront mis en ligne après que les TD ont eu lieu.

Téléchargement :
TD Enoncé Corrigé
TD1 - Opérations sur les matrices, inversion de matrice pdf pdf
TD2 - Espace vectoriel, géométrie, rang pdf pdf
TD3 - Matrices de stoechiométrie, diagonalisation pdf pdf
TD4 - Equations différentielles pdf pdf
TD5 - Systèmes d’équations différentielles pdf pdf
TD6 - Application sous Excel pdf excel excel